激光共聚焦顯微鏡更適合觀察帶有熒光標記的材料，例如熒光染料、熒光抗體、熒光蛋白轉基因材料等。這些材料能夠在激光的激發下產生熒光信號，而激光共聚焦顯微鏡正是通過檢測這些熒光信號來形成圖像的。

激光共聚焦顯微鏡具有高分辨率的三維光學成像技術，能夠逐層掃描樣品并實現三維成像。這種技術使得激光共聚焦顯微鏡在觀察細胞或亞細胞形態結構、鑒定細胞或組織內生物大分子等方面具有獨特的優勢。例如，它可以用于檢測蛋白質抗體及其他分子，觀察細胞凋亡，以及觀察細胞骨架結構等。

此外，激光共聚焦顯微鏡還可以對完整、厚實的標本進行直接、無創、連續的光學切片，很大程度地減少了樣品制備和橫向分辨率的微小改進。同時，它還具有豐富的測量結果，包括高分辨率的2D和3D攝影，以及非接觸粗糙度測量、膜厚度測量、熒光分析等功能。

需要注意的是，對于可見光染色的材料，如HE染色的切片，雖然可以通過目鏡觀察到，但激光共聚焦顯微鏡無法獲得彩色圖片，也無法實現三維成像。因此，在選擇使用激光共聚焦顯微鏡時，需要根據具體的實驗需求和樣品特性進行權衡和考慮。